生命學(xué)院馬涵慧課題組與合作者開(kāi)發(fā)出新型4D基因組成像工具
我校生命學(xué)院馬涵慧教授課題組與麻省大學(xué)醫(yī)學(xué)院Thoru Pederson教授合作開(kāi)發(fā)了新型的活細(xì)胞 DNA標(biāo)記系統(tǒng)“CRISPR-Sirius”。 北京時(shí)間2018年10月31日,相關(guān)成果以“CRISPR-Sirius: RNA scaffolds for signal amplification in genome imaging”為題,在知名學(xué)術(shù)期刊《自然-方法》(Nature Methods)上在線(xiàn)發(fā)表。CRISPR-Sirius極大地提高了在活細(xì)胞中跟蹤DNA的靈敏度和多樣性。為研究3D基因組動(dòng)態(tài)結(jié)構(gòu)如何在時(shí)間維度上變化(4D)、如何影響基因的轉(zhuǎn)錄和調(diào)控、如何決定細(xì)胞的命運(yùn)奠定了很好的基礎(chǔ)。人類(lèi)基因組含有約30億個(gè)DNA堿基對(duì),細(xì)胞里的基因組DNA大約為2米長(zhǎng),而細(xì)胞核的大小一般在10-20微米左右。染色體是如何高度折疊成3D結(jié)構(gòu)并動(dòng)態(tài)地調(diào)控基因表達(dá)一直是研究熱點(diǎn)。染色體構(gòu)象捕獲(Hi-C,Dekker J et al., Science2002)和高通量DNA原位雜交(MERFISH, Wang S et al., Science2016)等技術(shù)正在被廣泛地應(yīng)用到3D基因組研究中,但這些技術(shù)主要應(yīng)用在固定細(xì)胞...
2018-10-31